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摘要:
目的:通过对3株真菌的rDNA-ITS序列进行分析,以探讨、说明基于核糖体RNA基因(即rDNA)内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)的多态性的序列分析(rDNA-ITS序列分析)在真菌鉴定中的应用.方法:通过PCR扩增与测序的方法测得待检真菌菌株的rDNA-ITS序列,从GENBANK获取相似序列,使用BLAST和DNAMAN工具对rDNA-ITS序列进行比对分析.结果:1号真菌菌株与Xylariales sp.LM40(属炭角菌目)同源性高,但尚不能鉴定到具体的属、种;2号真菌菌株可鉴定到种,为草酸青霉Penicillium oxalicum;3号真菌菌株可鉴定到种内组水平,为近平滑假丝酵母Ⅲ组(最新命名为Candida metapsilosis).结论:相对于传统的真菌形态学鉴定方法,rDNA-ITS序列分析用于真菌鉴定更客观、省时、简便、快速,但目前也存在一定的应用限制(受基因库的完善程度、高度同源性序列的多少以及具体物种ITS区的可变程度等影响)并不能鉴定出所有真菌,宜与传统的形态学鉴定方法相结合用于真菌鉴定.
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文献信息
篇名 rDNA-ITS序列分析在真菌鉴定中的应用
来源期刊 中国卫生检验杂志 学科 医学
关键词 rDNA 内转录间隔区(ITS) PCR 测序 真菌 鉴定
年,卷(期) 2008,(10) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 1958-1961
页数 4页 分类号 R446.5
字数 3520字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1004-8685.2008.10.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 高雯洁 8 239 5.0 8.0
2 沈志英 13 266 5.0 13.0
3 王恒辉 15 293 7.0 15.0
4 陈黎霞 9 266 5.0 9.0
5 燕勇 12 293 6.0 12.0
6 李卫平 2 223 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
rDNA
内转录间隔区(ITS)
PCR
测序
真菌
鉴定
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国卫生检验杂志
半月刊
1004-8685
41-1192/R
大16开
郑州市经一路12号
80-152
1991
chi
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