基于相邻模式段组合的生物序列模式挖掘算法

• 作者: 尚学群 王淼 薛贺
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 前缀 频繁集 相邻频繁模式段 模式组合
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 数据库与信息处理
• 页码范围: 190-193
• 页数: 4页
• 分类号: TP311
• 字数: 4824字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2008.02.056

摘要

传统的序列模式挖掘算法应用在生物序列上有其局限性,根据生物序列的特点,提出了基于相邻频繁模式段的模式挖掘算法-JPS.首先产生相邻频繁模式段,然后对这些频繁模式段进行组合,产生新的频繁模式.通过实验分析,该方法在相似性很强的序列数据库中比传统的PrefixSpan算法效率高.通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚学群	西北工业大学计算机学院	23	67	5.0	5.0
2	王淼	西北工业大学计算机学院	24	160	6.0	11.0
3	薛贺	西北工业大学计算机学院	19	228	7.0	15.0