AIDS患者合并感染耶氏肺孢子虫的 ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列测定及基因型初步分析

• 作者: 张陆娟 张鸿满 林睿 欧阳颐 江河 秦英梅 黄绍标 黎学铭
• 来源期刊: 广西医学
• 学科: 医学
• 关键词: AJDs 痰液 耶氏肺孢子虫 内转录间隔区(ITS) 序列测定 基因型
• 年，卷（期）: 2008,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1831-1833
• 页数: 3页
• 分类号: B512.19|R382.3
• 字数: 2496字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-4304.2008.12.001

摘要

目的 测定AIDS患者痰液标本中耶氏肺孢子虫的ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列并进行基因型分析.方法 收集AJDS患者痰液标本,二硫苏糖醇(DTT)消化处理后进行六亚甲基四胺银(GMS)染色镜检;提取肺孢子虫DNA,巢式PCR扩增后进行测序,用Blast程序和DNAMAN软件对所测序列进行同源性检索和序列间比对,并和SD大鼠卡氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列进行比较分析.结果 GMS染色法未检测到肺孢子虫,巢式PER成功扩增出4例(31%),其ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因序列长度为469 bp,ITS1、5.8S rDNA、rTS2基因片段分别为146、158、165 bp,与SD大鼠ITS1-5.8S rDNA-ITS2的基因同源性为86%(152/176),其中多为5.8S rDNA同源86%(136/158),ITS基因间未发现显著性同源;病例间耶氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的基因同源性为98%～99%,其中5.8S rDNA高度保守,ITS1基因存在4个差异位点并具规律性,据此把耶氏肺孢子虫初步分为A型和B型;ITS2基因存在3个基因位点,但差异无规律性.结论 成功从AIDS患者痰液标本中获取耶氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因序列,其和大鼠源基因差异明显,不同人源宿主耶氏肺孢子虫可存在不同基因型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄绍标		34	190	9.0	11.0
2	黎学铭		57	261	9.0	13.0
3	江河		32	134	6.0	8.0
4	林睿		29	156	7.0	11.0
5	张鸿满		48	248	9.0	12.0
6	张陆娟		18	45	4.0	5.0
7	欧阳颐		31	111	5.0	9.0
8	秦英梅		8	25	3.0	4.0