油桐种子FADX基因的克隆和序列分析

• 作者: 李元 李鹏 汪阳东 魏建民
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 油桐 FADX基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 4753-4755
• 页数: 3页
• 分类号: S794.3
• 字数: 2485字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2008.11.042

摘要

[目的]克隆油桐种子FADX基因全长cDNA.对该基因作生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能提供参考.[方法]以未成熟的油桐种子为材料,利用改良TRIzoL法提取总RNA,并根据GenBank中已经登录的α-桐酸合成酶基因FADX的序列,设计特异性引物;采用RT-PCR方法,克隆得到FADX基因全长cDNA,应用Antheprot软件和InterProScan对该基因进行了生物信息学分析.[结果]该序列5'端和3'端非编码区序列长度分别为13、47 bp,舍有1个开放阅读框(14-1174bp),编码386个氨基酸,含有典型的脂肪酸脱氢酶结构域;相对分子量是44 343.0,理论等电点为8.33.二级结构预测表明,该蛋白α-螺旋含量占29%,β-折叠占32%,转角占6%.[结论]该蛋白属于脂肪酸脱氢酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏建民	内蒙古农业大学生物工程学院	20	150	7.0	11.0