油桐β-酮脂酰-ACP还原酶(KAR)基因的克隆与序列分析

• 作者: 刘美兰 周俊琴 张琳 王建勇 谭晓风 龙洪旭
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 油桐 β-酮脂酰-ACP还原酶 Vf_KAR1 Vf_KAR2 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 962-969
• 页数: 8页
• 分类号: S794.302
• 字数: 4715字
• 语种: 中文

摘要

以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了2条KAR基因的全长cDNA,分别命名为Vf_KAR1和Vf _KAR2(GenBank登录号:KF025646,KF025647).生物信息学分析结果表明,Vf_KAR1和Vf_KAR2基因的CDS长度分别为993 bp和900 bp,分别编码331个和300个氨基酸;与其它物种的KAR氨基酸序列具有较高的相似性,Vf_KAR1与蓖麻的相似度最高,达82％;Vf_KAR2基因与花生、辣椒的相似度高达76％;2条KAR基因的多肽都含叶绿体转运肽,但是都没有信号肽;Vf_KAR1有1个明显的跨膜螺旋拓扑结构和1个疑似跨膜螺旋拓扑结构,Vf_KAR2有2个疑似的跨膜螺旋拓扑结构;肽链都表现为疏水性,都有典型的活化中心三联体(Ser-Tyr-Lys);三级结构都有典型的Rossmarn折叠特征.因此,初步推测Vf_KAR1和Vf_KAR2是油桐β-酮脂酰-ACP还原酶KAR基因家族的两个成员.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭晓风	中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室	181	2634	25.0	40.0
2	张琳	中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室	60	540	13.0	20.0
3	龙洪旭	中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室	27	243	9.0	15.0
4	刘美兰	中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室	10	29	3.0	5.0
5	周俊琴	中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室	6	14	2.0	3.0
6	王建勇	中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室	2	11	2.0	2.0