钙调蛋白构象变化路径

• 作者: 张健 朱维良 杨坤 王希诚 蒋华良
• 来源期刊: 大连理工大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 钙调蛋白(CaM) 常规分子动力学(CMD) 靶向分子动力学(TMD) 全局构象变化
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 化学化工、动力工程
• 页码范围: 499-505
• 页数: 7页
• 分类号: Q71
• 字数: 4025字
• 语种: 中文

摘要

根据已发现的钙调蛋白(CaM)打开和闭合两种不同的构象,研究了拮抗剂对构象变化的影响以及CaM全局构象变化路径.首先,进行了含拮抗剂和不合拮抗剂的两种常规分子动力学模拟,结果表明:CaM在独立存在时具有从闭合状态开启的趋势,它的构象动态变化推动了CaM变构功能的实现;拮抗剂具有将CaM的构象变化"锁住"在闭合状态的功能,有利于CaM控制一些激酶和磷酸酶的活性.在此基础上,进一步用靶向分子动力学模拟了CaM从闭合到打开的构象变化过程,得到一条稳定的变化路径和4个可能的过渡态构象.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王希诚	大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室	54	538	12.0	21.0
2	杨坤	大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室	2	7	1.0	2.0
3	张健	中科院上海药物研究所新药研究国家重点实验室	1	7	1.0	1.0
4	蒋华良	中科院上海药物研究所新药研究国家重点实验室	1	7	1.0	1.0
5	朱维良	中科院上海药物研究所新药研究国家重点实验室	1	7	1.0	1.0