采用Levenberg-Marquardt算法的信号转导通路模型参数估计

• 作者: 刘太元 岳红 王宏 贾建芳
• 来源期刊: 生物医学工程学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 系统生物学 参数估计 参数可辨识性 信号转导通路 Levenberg-Marquardt算法
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 22-29
• 页数: 8页
• 分类号: Q-232
• 语种: 中文

摘要

建立信号转导通路的数学模型,以便定量对其进行研究是系统生物学的一个基本任务,但是,参与信号转导通路的蛋白质众多,相互关系复杂,以及信号转导通路表现出的强非线性特性使模型未知参数的估计十分困难.以肿瘤坏死因子α(Tumor necrosis α, TNFα)诱导的细胞核因子κB(Nuclear Factor-κB, NF-κB)信号转导通路为例,研究了基于Levenberg-Marquardt算法在信号转导通路模型参数估计中的应用,该方法包括两部分,首先采用正交化方法确定未知参数的可辨识性,然后采用Levenberg-Marquardt优化算法在给定的测量时间序列下,估计参数值.仿真结果证明该方法能较好地估计信号转导通路模型的未知参数并且具有一定的稳定性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王宏	中国科学院自动化研究所	143	1658	22.0	34.0
2	贾建芳	中国科学院自动化研究所	9	17	2.0	4.0
3	刘太元	中国科学院自动化研究所	8	12	1.0	3.0
4	岳红	中国科学院自动化研究所	21	277	8.0	16.0