基于多策略滑动伸缩窗特征提取方法预测蛋白质同源寡聚体

• 作者: 张绍武 李启鹏 潘泉 陈伟
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 同源寡聚体 支持向量机 特征提取 多策略滑动伸缩窗 多策略滑动伸缩窗特征
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 335-342
• 页数: 8页
• 分类号: Q617
• 语种: 中文

摘要

寡聚蛋白质广泛地参与多种生命活动,对其预测研究有重要的意义.文章从蛋白质序列出发,提出多策略滑动伸缩窗特征提取方法,采用"一对一"的多类分类策略,对蛋白质同源寡聚体进行预测研究.结果表明,在Jackknife检验下,基于支持向量机的多策略滑动伸缩窗特征和氨基酸组成成分构成的特征集在加权情况下,其总分类精度最高达到了75.37%,比单纯的氨基酸组成成分法提高10.05%,比参考文献最好特征BG Zhang 提高了3.82%.说明多策略滑动伸缩窗特征提取方法对于蛋白质同源寡聚体分类,是一种非常有效的特征提取方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘泉		544	9437	45.0	77.0
2	张绍武		66	809	14.0	26.0
3	陈伟		31	159	8.0	10.0
4	李启鹏		5	13	2.0	3.0