大豆疫霉多态性SSR标记开发及遗传多样性分析

• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆疫霉 基因组 SSR标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 337-346
• 页数: 10页
• 分类号: S435.651
• 字数: 4849字
• 语种: 中文

摘要

用FastPCR软件在大豆疫霉全基因组中搜索到1 234个含2～4个重复基元精确SSRs.选择260个SSRs设计引物,经对大豆疫霉5个分离物的基因组DNA检测,有212对(81.5%)有效扩增出SSR特征条带,112对(52.8%)扩增多态性.用18对多态性SSR引物分析了来自美国、中国黑龙江省和福建省大豆疫霉分离物的遗传多样性,在73个分离物中共扩增出112个等位变异,变异范围为4～9,平均为6.22个,表明选择的引物对具有高的多态性.在3个大豆疫霉群体中,黑龙江省和福建省分离物的遗传距离最近,美国和福建省分离物的遗传距离最远.UPGMA聚类将73个分离物划分为6组,其中8个美国分离物(72.73%)和53个中国分离物(85.48%)被聚类在一起,表明大豆疫霉中国分离物与美国分离物可能具有共同的祖先,中国分离物可能为外来种.