甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析

• 作者: 彭德良 彭焕 黄文坤
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯腐烂茎线虫 β-1 4-内切葡聚糖酶 GHF5家族
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1035-1041
• 页数: 7页
• 分类号: S188
• 字数: 4219字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.06.015

摘要

β-1,4内切葡聚糖酶是植物寄生线虫食道腺分泌的一类细胞壁降解酶,在植物线虫的侵染过程中具有重要的作用.以马铃薯腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)为材料,用RT-PCR和RACE方法,获得了β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cDNA全长,并将该基因命名为Dd-eng-1b(GenBank登录号为FJ430142).此cDNA全长序列为1 640 bp,包括1个1 443 bp的完整ORF,编码1含481个氨基酸的蛋白,其理论分子量为50.89 kD,等电点pI为6.94.序列比对分析表明,含有糖基水解酶的保守结构域,属于纤维素酶第五家族成员,N端具有19个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBD Ⅱ).cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含4个内含子,长度分别为36、76、187和344bp,切割点符合5'-GT……AG-3'的规律.系统进化树分析表明,该基因与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测该基因可能来源于细菌的水平基因转移.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭德良	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	77	1237	17.0	32.0
2	黄文坤	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	34	304	12.0	15.0
3	彭焕	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	14	102	7.0	9.0