萝卜扩展蛋白基因RsEXPB1克隆与表达特征分析

• 作者: 周艳孔 姜立娜 孙新菊 柳李旺 荆赞革 龚义勤
• 来源期刊: 分子植物育种
• 学科: 农学
• 关键词: 萝卜(Raphanus sativus L.) 扩展蛋白 基因克隆 表达特征
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 新基因、新种质、新品种
• 页码范围: 801-805
• 页数: 5页
• 分类号: S6
• 字数: 3183字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/mpb.007.000801

摘要

本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364).其编码区基因组序列长度为1 430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR获得长度为898 bp的cDNA,开放读码框(ORF)为29～820 bp,推导编码263个氨基酸,含有1个组氨酸(His-Phe-Asp,HrD)功能域,ORF和推导蛋白序列与拟南芥AtEXPB3(GenBank accession No.NM118965)同源性分别为87%、92%.半定量RT-PCR检测到该基因主要在萝卜生育前期的幼叶、肉质根木质部和韧皮部中表达,且表达丰度可能与该部位细胞生长分裂状态相关,差异较明显.