3株鸭肝炎病毒Ⅰ型结构基因VP1的克隆及序列分析

• 作者: 刘娣 刘家森 司昌德 姜骞 孟庆文 曲连东 甘一迪 郭东春 韩凌霞
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭肝炎病毒(DHV) VP1基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 952-957
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3784字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2009.06.028

摘要

通过RT-PCR方法扩增鸭肝炎病毒DHV-1:161/79/V、YH、HN株的VP1基因的核苷酸序列.系统发育分析表明,3株病毒与已发表的DHV-1结构基因VP1核苷酸和氨基酸的同源性分别为92.7%～96.9%和95.4%～96.6%,与DHV-1变异株核苷酸和氨基酸序列的相似性均分别低于75%和88%,表明3株病毒属于DHV-1,与变异株是不同的血清型.强毒DHV-1:161/79/V的VP1蛋白第49和第183位氨基酸为T和H,弱毒DHV-1:YH、HN为S和Q,推测这2处位点的改变可能与病毒的强弱有关;DHV-1和其变异株的VP1蛋白均没有保守的RGD序列;变异株N-DHV:90D、04G在第50和51位比DHV-1多2个氨基酸(Q和D),在第147和185位各缺失1个氨基酸(E和L),而在变异株DHV:AP-03337、AP-04009、AP-04114、AP-04203的第145和146位比DHV-1多了2个氨基酸(G、G);不同血清型的鸭肝炎病毒在46-64位、95-149位、180-223位抗原指数差别较大,推测这些位点的改变可能影响病毒的生物学特性.