中华鲟铁蛋白基因cDNA全长克隆与组织表达分析

• 作者: 施志仪 程千千 陈晓武
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 中华鲟 铁蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 144-150
• 页数: 7页
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2009.02144

摘要

根据铁蛋白基因的保守序列,搜索GenBank数据库中华鲟的EST数据库得到一条同源序列.通过RT-PCR的方法对该序列进行扩增,修改其测序错误,获得中华鲟铁蛋白亚基cDNA全长,经过注释提交GenBank数据库,获取序列登录号EU348782.该cDNA长度为896bp,包含531bp的完整编码区,推测编码的蛋白质为176aa,分子量为20339.9Mr,理论等电点为5.66.它和大两洋鲑鱼铁蛋白序列同源性最高,达到82.9%.该基闪在中华鲟肝脏、胰脏、肌肉、脑、心脏、鳃和胃粘膜等多种组织表达,在胰脏和心脏中表达量较高,在肌肉组织中表达较低.根据同源模建的方法得到该蛋白质三维结构,其包括5个α螺旋和10个转角结构,和人、蛙和细菌的铁蛋白均能很好的叠合,表现了很高的相似性,表明该蛋白结构和功能在基因进化中的高度保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海海洋大学生物技术研究中心	48	217	9.0	11.0
2	陈晓武	上海海洋大学生物技术研究中心	19	53	4.0	6.0
3	程千千	上海海洋大学生物技术研究中心	9	45	5.0	6.0