西藏米拉山土壤古茵16S rRNA及amoA基因多样性分析

• 作者: 孟祥伟 杨宇红 茆振川 谢丙炎 陈国华
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 古菌 16SrRNA基因 amoA基因 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2009,（8）
• 所属期刊栏目: 分类和进化
• 页码范围: 994-1002
• 页数: 9页
• 分类号: Q939
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2009.08.003

摘要

[目的]本研究旨在了解西藏米拉山高寒草甸土壤中古菌及氨氧化古菌群落结构组成情况.[方法]采用未培养技术直接从土壤中提取微生物总DNA,分别利用通用引物构建古菌16S rRNA基因和氨氧化古菌amoA基因克隆文库.利用DOTUR软件将古菌和氨氧化古菌序列按照相似性97%的标准分成若干个可操作分类单元(OTUs).[结果]通过构建系统发育树,表明古菌16s rRNA基因克隆文库包括泉古菌门和未分类的古菌两大类,并且所有泉古菌均属于热变形菌纲.氨氧化古菌amoA基因克隆文库中序列均为泉古菌.古菌16s rRNA基因和古菌amoA基因克隆文库分别包括64个OTUs和75个OTUs.[结论]西藏米拉山高寒草甸土壤中古菌多样性比较丰富,表明古菌在高寒草甸土壤的氮循环中可能具有重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨宇红	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	89	1367	22.0	32.0
2	谢丙炎	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	175	3639	30.0	51.0
3	茆振川	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	40	564	12.0	22.0
4	陈国华	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	50	267	10.0	12.0
5	孟祥伟	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	1	6	1.0	1.0