基于生物信息学的植物乳酸杆菌表层黏附蛋白的筛选及

• 作者: 周玉坤 张明 张鹏 杭晓敏 沈通一 秦环龙 陈红旗
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 植物乳酸杆菌 表层黏附蛋白 蛋白表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（16）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1626-1631
• 页数: 6页
• 分类号: R5
• 字数: 6575字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2009.16.006

摘要

目的: 筛选、鉴定及验证植物乳酸杆菌CGMCC No. 1258表层黏附蛋白.方法: 用盐酸胍结合超速离心法提取表层膜蛋白, 通过HRP标记的黏蛋白作抗体Westernblot找到含有黏附蛋白的条带进行质谱分析,生物信息学的TPP软件分析获得可能的蛋白,进行蛋白的分段表达克隆, 并对纯化的蛋白用Western blot进行再次鉴定找到靶蛋白. 同时将黏蛋白连接的sepharose 4B柱提取菌体黏附蛋白, 通过制备的靶蛋白多克隆抗体对菌体黏附蛋白作Western blot进一步验证.结果: 表层蛋白提取后, 电泳及Western blot结果显示30-33 kDa处可及HRP标记的黏蛋白结合的阳性条带, 随后进行质谱及TPP分析获得的蛋白为: (1)A型GTP连接蛋白; (2)丙酮酸氧化酶; (3)细胞分裂激活蛋白; (4)整合膜蛋白;(5)后期能力蛋白. 并进行克隆表达及分段表达, 并在此后的Western blot鉴定中呈强阳性条带显示靶蛋白是整合膜蛋白的第2段. 在应用该靶蛋白制备的多克隆抗体进一步Westernblot验证试验中发现同菌体黏附蛋白相作用的强阳性条带.结论: 植物乳酸杆菌表层黏附蛋白为整合膜蛋白, 并且该蛋白的黏附区域位于其第2段氨基酸序列中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张鹏	上海交通大学附属第六人民医院外科	178	1276	19.0	27.0
2	张明	上海交通大学附属第六人民医院外科	89	592	12.0	21.0
3	沈通一	上海交通大学附属第六人民医院外科	12	197	6.0	12.0
4	杭晓敏	上海交通大学附属第六人民医院外科	11	165	6.0	11.0
8	周玉坤	上海交通大学附属第六人民医院外科	5	31	4.0	5.0
9	陈红旗	上海交通大学附属第六人民医院外科	14	102	6.0	9.0