ISSR和EST-SSR标记在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种遗传多样性上的比较分析

• 作者: 姚明哲 梁月荣 王新超 陈亮 马春雷
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 茶树 SSR EST-SSR 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 897-903
• 页数: 7页
• 字数: 5012字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/mpb.007.000897

摘要

本研究利用ISSR和EST-SSR标记对中国13个、日本4个与肯尼亚5个茶树品种的遗传多样性进行分析,重点比较了ISSR和EST-SSR在多态性位点数、引物解析能力、多态性信息含量和标记系数等方面的差异.结果表明在位点检测能力上ISSR明显高于EST-SSR,每条ISSR引物可检测的平均条带数(12.5)比每对EST-SSR引物(3.1)高三倍.ISSR标记的Rp值是EST-SSR标记的6.3倍,其多态性信息含量(PIC)和标记系数(MI)也明显高于EST-SSR,这表明ISSR具较高的多态性位点检测能力和较高的标记效率.EST-SSR揭示的Nei基因多样性(H=0.28)高于ISSR(0.21),这种差异进而会影响到遗传距离和聚类分析的结果.在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种的遗传差异上,两种标记表现出较一致的趋势,中国茶树品种在多态性位点数量、Nei基因多样性、遗传距离上均大于日本和肯尼亚的茶树品种.研究还表明,由于EST-SSR可检测到等位位点的变异,它比ISSR可以更准确地反映和揭示供试品种的遗传多样性水平.同时由于单个EST-SSR标记检测到的位点数量较ISSR标记少,且特异性较强,谱带较易分辨,因此比ISSR标记更适用于对大量样本的分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁月荣	浙江大学茶叶研究所	152	3087	31.0	45.0
2	陈亮	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心	108	1896	22.0	41.0
3	姚明哲	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心	24	423	10.0	20.0
5	王新超	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心	36	529	11.0	22.0
6	马春雷	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心	23	325	10.0	17.0