猪圆环病毒II 型 rep蛋白的亚细胞定位生物信息学析

• 作者: 姜雪梅 徐志文 李昕然 王印
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: PCV-II rep蛋白 生物信息学 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 动物科学·资源昆虫
• 页码范围: 1110-1113
• 页数: 4页
• 分类号: S828
• 字数: 1873字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4829.2009.04.050

摘要

从GenBank 发表的PCV-2全基因组序列,随机选择其中的32 个全基因序列,做序列比对和同源性比较,绘制系统进化树,在注释中找到ORF1编码的rep蛋白氨基酸序列, 用在线生物信息学工具对其进行亚细胞定位分析.结果基本符合"来自同一地区的基因序列同源性较高"的规律,表明了PCV的高度保守性, 亚细胞定位分析发现其rep蛋白定位于核区的指数为0.76,这与病毒在宿主细胞核内复制分不开.结果同时表明其定位于过氧化物酶体的指数显著不同于其他(过氧化物酶体平均0.36,可变,溶酶体、线粒体均为0.1不变)这可能与pcv的组织嗜性以及复制靶细胞(多为单核/巨噬细胞)的原因相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐志文	四川农业大学动物医学院	184	909	15.0	20.0
2	王印	四川农业大学动物医学院	104	558	13.0	18.0
3	李昕然	四川农业大学动物医学院	2	4	1.0	2.0
4	姜雪梅	四川农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0