甜杨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因的电子克隆及其功能预测

• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 甜杨 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶 电子克隆
• 年，卷（期）: 2009,（29）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 14054-14058,14097
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 字数: 5529字
• 语种: 中文

摘要

[目的]对甜杨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)进行克隆及功能预测.[方法]采用电子克隆和RT-PCR相结合的方法首次从甜杨中分离了G6PDH基因,通过Blast和其他生物信息学软件进行功能预测.[结果] 甜杨G6PDH基因的cDNA长1 697 bp,可编码510个氨基酸,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与其他植物G6PDH存在着较高的同源性,说明所获得的cDNA是甜杨G6PDH基因(PsG6PDH,AY445917).同时,运用PCR扩增技术获得了甜杨G6PDH基因组序列,测序结果表明,基因组DNA长度为5 040 bp,含有15个外显子和14个内含子.Southern杂交结果表明,G6PDH基因在甜杨的基因组中可能是单拷贝或者低拷贝.通过网络服务器平台进行PsG6DH的功能预测,结果显示,PsG6PDH为G6PDH的成员之一,含有NADP结合区和G6P结合区2个保守功能域,具有多个磷酸化位点和跨膜区域,但不含有信号肽,表明PsG6DH可能作为膜受体而起作用.另外,G6PDH的电子表达谱分析结果发现,G6PDH在多种组织和不同发育过程均表达,并涉及各种逆境胁迫应答反应,这也说明了G6PDH在植物生长反育中的重要地位.[结论]可为下一步研究PsG6PDH基因的分子功能提供参考.