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凤尾蕨科植物rbcL基因的适应性进化分析
凤尾蕨科植物rbcL基因的适应性进化分析
作者:
张冰
森林
王艇
苏应娟
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
凤尾蕨科
rbcL基因
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶
放松分子钟模型
正选择位点
摘要:
为深入理解蕨类植物辐射式物种分化的分子适应机制,在时间框架下,采用位点模型和分支-位点模型对凤尾蕨科植物rbcL基因的进化式样进行了分析.通过比较模型M1a/M2a和M7/M8,在氨基酸水平上共鉴定出6个正选择位点:1491、251M、255V、282F、359S和375F,其中位点282F对维持Rubisco功能有重要作用.分别检验凤尾蕨科的附生分支和水蕨类分支发现,前者不具适应性进化位点,而后者有两个位点(230A和247C)经历正选择.相对于荫蔽的光条件,水生生境可能对RbcL亚基的选择作用更强.另外,基于UCLD分子钟模型估算出的风尾蕨科各分支分化时间表明,该科物种丰富度的辐射式增长发生在新生代渐新世,推测古、始新世最热事件可能对物种分化的形成也产生一定作用.这对认识薄囊蕨类如何应对被子植物兴起导致的陆地生态系统改变具重要意义.
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系统位置
rbcL
中国蕨科
珠蕨科
凤尾蕨科
弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析
弯枝藻属
rbc L基因
蛋白质结构预测
适应性进化
内容分析
文献信息
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
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(/年)
文献信息
篇名
凤尾蕨科植物rbcL基因的适应性进化分析
来源期刊
热带亚热带植物学报
学科
生物学
关键词
凤尾蕨科
rbcL基因
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶
放松分子钟模型
正选择位点
年,卷(期)
2010,(1)
所属期刊栏目
植物生理与分子生物学
研究方向
页码范围
1-8
页数
8页
分类号
Q349
字数
5590字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1005-3395.2010.01.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
苏应娟
中山大学生命科学学院
48
804
18.0
27.0
2
张冰
中山大学生命科学学院
58
269
10.0
14.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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同被引文献
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rbcL基因
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶
放松分子钟模型
正选择位点
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带亚热带植物学报
主办单位:
中国科学院华南植物园
广东省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-3395
CN:
44-1374/Q
开本:
大16开
出版地:
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2032
总下载数(次)
6
总被引数(次)
31320
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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热带亚热带植物学报2010年第5期
热带亚热带植物学报2010年第4期
热带亚热带植物学报2010年第3期
热带亚热带植物学报2010年第2期
热带亚热带植物学报2010年第1期
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