弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析

• 作者: 冯佳 刘琪 南芳茹 吕俊平 巩超彦 谢树莲 韩雨昕
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 弯枝藻属 rbc L基因 蛋白质结构预测 适应性进化
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 36-44
• 页数: 9页
• 字数: 5625字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/jtsb.3909

摘要

为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征, 选取弯枝藻属 (Compsopogon) 及相近外类群的rbc L基因共17条, 利用PAML 4.9软件, 对弯枝藻属rbc L基因编码蛋白进行生物信息学分析, 并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测.结果表明, 弯枝藻属rbc L基因编码蛋白的二级结构主要由α螺旋和β折叠构成, 结构稳定.采用最大似然法构建的系统发育树表明, 内类群为单一物种, 分为3个小分支, 具有一定地理分布规律.在3种进化模型中均未检测到统计上显著的正选择位点, 表明绝大多数位点处于负选择压力下.因此, 弯枝藻属rbc L基因未发生适应性进化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢树莲	山西大学生命科学学院	183	1093	17.0	22.0
2	冯佳	山西大学生命科学学院	100	447	10.0	16.0
3	吕俊平	山西大学生命科学学院	29	70	5.0	6.0
4	刘琪	山西大学生命科学学院	28	68	5.0	6.0
5	南芳茹	山西大学生命科学学院	16	23	3.0	4.0
6	韩雨昕	山西大学生命科学学院	2	3	1.0	1.0
7	巩超彦	山西大学生命科学学院	3	10	2.0	3.0