早酥梨抗黑星病相关新基因Vnp1的克隆及其表达分析

• 作者: 张朝红 张洪磊 王跃进
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梨 梨黑星病 抗病基因同源类似物 RACE 半定量RT-PCR
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 239-245
• 分类号: S4
• 字数: 5965字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.02.006

摘要

在前期已克隆得到的早酥梨(Pyrus bretschneideri cv.Zaosu)抗病基因同源类似物Pb-Zs3(GenBank登录号:EU939783)的基础上,通过RT-PCR获得Pb-Zs3的cDNA序列,并利用RACE技术获得该基因的全长cDNA序列,命名为早酥梨抗黑星病相关基因(Vnp1),提交至GenBank(GenBank登录号:FJ763188).生物信息学分析表明,早酥梨Vnp1基因的全长cDNA序列为1200 bp,包含一个完整的921 bp的开放读码框架(ORF),编码306个氨基酸残基,预测其分子质量为34.6 kD.同时,该基因含有与抗病相关的功能结构域核酸结合位点(NB-ARC),同源性比对显示其与苹果黑星病菌(Venturia inaequails)诱导后的苹果EST序列ABEA004598(GenBank登录号:EB150292)同源性达71%.对早酥梨Vnp1基因进行半定量RT-PCR研究的结果表明,该基因在梨黑星病菌(Venturia nashicola)诱导后216 h内的叶片中的表达水平呈明显上升趋势.