前蛋白转化酶枯草溶菌素9参与Caspase-3活化的生物信息学分析

• 作者: 刘录山 唐志晗 姜志胜 王佐
• 来源期刊: 中国动脉硬化杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 前蛋白转化酶枯草溶菌素9 半胱天冬氨酸蛋白酶3 半胱天冬氨酸蛋白酶9 细胞凋亡 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 787-791
• 分类号: Q81
• 语种: 中文

摘要

目的 研究前蛋白转化酶枯草溶菌素9促凋亡的作用是否与活化凋亡通路Caspase-3相关.方法 用80 mg/L氧化型低密度脂蛋白孵育人脐静脉内皮细胞24 h,同时设空白对照组、转染试剂组、阴性对照组和80 nmol/L前蛋白转化酶枯草溶菌素9 siRNA+80 mg/L氧化型低密度脂蛋白组,流式细胞术测定细胞凋亡率,免疫印迹法和酶联免疫吸附法分别检测Caspase-3的表达及活性.然后通过生物信息学方法对前蛋白转化酶枯草溶菌素9与Caspase-8和Caspase-9进行比较,找出它们之间的序列相似程度,以及是否存在共同的功能结构域.结果 前蛋白转化酶枯草溶菌素9 siRNA能抑制氧化型低密度脂蛋白诱导的Caspase-3蛋白表达和活性增加.生物信息学分析表明,前蛋白转化酶枯草溶菌素9、Caspase-8、Caspase-9三者的序列同源性高达22.14%,三者在C端的二级结构十分接近,特别是前蛋白转化酶枯草溶菌素9和Caspase-9的螺旋、片层、转角、无规则卷曲含量十分接近,三级结构分析发现前蛋白转化酶枯草溶菌素9和Caspase-9的外观轮廓相近,且在腹部中央都有一个裂口,显示前蛋白转化酶枯草溶菌素9和Caspase-9可能具有相同的酶切活性.结论 前蛋白转化酶枯草溶菌素9具有与Caspase-9相似的功能结构域,可能具有激活Caspase-3的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐志晗	南华大学心血管疾病研究所动脉硬化学湖南省重点实验室	80	344	9.0	13.0
2	刘录山	南华大学心血管疾病研究所动脉硬化学湖南省重点实验室	62	416	11.0	17.0
3	姜志胜	南华大学心血管疾病研究所动脉硬化学湖南省重点实验室	107	532	11.0	18.0
4	王佐	南华大学心血管疾病研究所动脉硬化学湖南省重点实验室	72	557	14.0	20.0