约束下多子女家系数据重组率的最大似然估计

• 作者: 冯荣锦 史宁中 周影 郭建华 韩国牛
• 来源期刊: 中国科学A辑
• 关键词: 约束参数问题 连锁分析 重组率 约束EM算法
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 971-984
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/012007-482

摘要

本文针对相型信息未知的三回交家系,讨论了在自然的序约束下重组率的估计问题.考虑了多后代数据的后代表型分类问题,给出了后代表型分类数的一个具体公式.基于表型分类所得数据,采用约束EM算法(REM)估计了两位点重组率.鉴于交换干扰的存在可能会影响到基因定位的精度,基于该估计,进一步考虑了有关生物体基因组中交换干扰的统计推断问题.实例和模拟研究均显示REM算法要优于无约束算法,并证实了多后代家庭会提供更多连锁信息这一观点.