牛LAP3基因内含子12和外显子13单核苷酸多态性

• 作者: 仲跻峰 张爱武 李秋玲 李荣岭 王长法 郑雪 鞠志花
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 生物学
• 关键词: 牛 LAP3基因 单核苷酸多态性 单链构象多态性 优势等位基因
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 74-79
• 分类号: Q31
• 字数: 4316字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2010.05.13

摘要

采用单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)、创造酶切位点PCR(created restriction site-PCR,CRS-PCR)、限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)以及直接测序方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛LAP3基因第12内含子和第13外显子的单核苷酸多态性(SNP).共检测到5个SNP,分别为24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)、24 564(G/A)和25 415(T/C),其中24 564(G/A)为首次报道的位点.经PCR-SSCP结合测序图谱发现24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)位点完全连锁,但该连锁位点在鲁西黄牛群体中未检测到.5个SNP位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛群体的优势等位基因相同,分别是T、T、T、G、T,其等位基因频率分别是T(CH 0.579/LY 1/BB 0.722)、T(CH 0.579/LY 1/BB 0.722)、T(CH 0.579/LY 1/BB 0.722)、G(CH 0.584/LY 0.775/BB 0.500)和T(CH 0.596/LY 0.796/BB 0.750),多态信息含量均在0.25至0.5之间,属于中度多态.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王长法	山东省农业科学院奶牛研究中心	107	675	13.0	18.0
2	李秋玲	山东省农业科学院奶牛研究中心	46	301	10.0	15.0
3	仲跻峰	山东省农业科学院奶牛研究中心	137	888	15.0	20.0
4	张爱武	吉林农业大学中药材学院	52	138	6.0	8.0
5	李荣岭	山东省农业科学院奶牛研究中心	22	51	4.0	6.0
6	鞠志花	山东省农业科学院奶牛研究中心	17	69	6.0	7.0
7	郑雪	吉林农业大学中药材学院	14	14	2.0	3.0