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西伯利亚鲟β-actin基因cDNA全长克隆、序列分析及其作为内参基因的应用研究
西伯利亚鲟β-actin基因cDNA全长克隆、序列分析及其作为内参基因的应用研究
作者:
宋佳坤
施志仪
程千千
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
西伯利亚鲟
β-actin
cDNA全长克隆
Sox2
内参基因
摘要:
采用同源克隆和RACE技术获得西伯利亚鲟(Acipenser baerii)β-actin基因cDNA全长,序列分析表明西伯利亚鲟β-actin基凶cDNA全长1322 bp,其包括的137 bp的5'端非翻译区,57 bp的3'端非翻译区和编码375个氨基酸残基的1128 bp开放阅读框.与其他物种比对,该基因具极高的保守性.同时也利用同源克隆技术获得了两伯利亚鲟Sox2基因的同源保守区,该序列长768 bp,编码256个氨基酸,也具较高的保守性,与其他物种的相似性在70%以上.以β-actin作为内参基因,对Sox2基因在西伯利哑鲟成鱼各组织及胚胎发育各时期进行实时荧光定量PCR检测,发现Sox2基因在不同组织中均有表达.其中,在肝、胰、肾、脑4个组织中表达量差距不大,均处于相对较低的水平,在肌肉组织中表达量最高,达到了肝脏的10.4倍.同时Sox2基因虽在西伯利亚鲟胚胎发育各时期均有表达,但表达也具明显的时间差异性.在受精卵期、囊胚期Sox2基因的相对表达量较低,在原肠期、神经胚期、视泡形成期和心脏形成期Sox2基因相对表达量较高,且在心脏形成期达到最高点.本研究为量化西伯利亚鲟发育分化过程中相关基因提供了坚实的参照工具,增加了后续试验的可信度,同时可为今后深入研究西伯利亚鲟Sox2在侧线神经节分化发育、细胞迁移过程中的作用提供基础参考依据.
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结构
表达
西伯利亚鲟、施氏鲟及其杂交种(西伯利亚鲟♀×施氏鲟♂) 的形态差异分析
西伯利亚鲟
施氏鲟
杂交
形态差异
判别分析
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
西伯利亚鲟β-actin基因cDNA全长克隆、序列分析及其作为内参基因的应用研究
来源期刊
中国水产科学
学科
农学
关键词
西伯利亚鲟
β-actin
cDNA全长克隆
Sox2
内参基因
年,卷(期)
2010,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1173-1182
页数
分类号
Q786|S917
字数
6631字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
施志仪
上海海洋大学水产与生命科学学院
48
217
9.0
11.0
2
程千千
上海海洋大学水产与生命科学学院
9
45
5.0
6.0
3
宋佳坤
上海海洋大学水产与生命科学学院
18
98
6.0
9.0
传播情况
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二级引证文献(3)
研究主题发展历程
节点文献
西伯利亚鲟
β-actin
cDNA全长克隆
Sox2
内参基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国水产科学
主办单位:
中国水产科学研究院
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1005-8737
CN:
11-3446/S
开本:
大16开
出版地:
北京市永定路南青塔村150号
邮发代号:
18-250
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
3187
总下载数(次)
1
总被引数(次)
54530
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