结核分枝杆菌PE和PPE家族蛋白抗原性的生物信息学分析

• 作者: 樊博 王巍 程小星
• 来源期刊: 中华临床医师杂志（电子版）
• 学科: 医学
• 关键词: 分枝杆菌,结核 计算生物学 抗原变异 PE家族 PPE家族
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 1362-1366
• 分类号: R3
• 字数: 3192字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cma.j.issn.1674-0785.2010.08.040

摘要

目的 应用生物信息学工具预测结核分枝杆菌PE和PPE家族的分泌性蛋白及分析其抗原性,减少抗原选择的盲目性,增加可靠性.方法 应用多种生物信息学工具SignalP、SecretomeP、DAS、NetMHC等分析结核分枝杆菌标准株H37Rv基因组中PE和PPE家族成员的蛋白序列,找出可能的分泌性蛋白以及其抗原决定簇序列.结果 在共168个PE和PPE家族成员中预测出23个可能的分泌性蛋白(PE家族20个,PPE家族3个),其中19个包含有与MHCⅠ和Ⅱ类分子高亲和力的肽段.结论 结核分枝杆菌PE、PPE家族蛋白可以通过生物信息学工具分析预测其抗原性,辅助指导实验.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王巍	解放军第309医院全军结核病研究所	55	314	9.0	16.0
2	程小星	解放军第309医院全军结核病研究所	35	111	5.0	7.0
3	樊博	解放军第309医院全军结核病研究所	1	3	1.0	1.0