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结核分枝杆菌RegX3基因表达情况及其蛋白的生物信息学分析
结核分枝杆菌RegX3基因表达情况及其蛋白的生物信息学分析
作者:
李冰洁
陈璐
原文服务方:
吉林医药学院学报
结合分枝杆菌RegX3基因
基因多态性
生物信息学
摘要:
目的:探讨结核分枝杆菌( MTB)菌株RegX3基因表达情况,并通过生物信息学技术分析预测其编码蛋白的结构和功能。方法从感染患者体内分离MTB,PCR方法扩增RegX3基因并测序,分析RegX3基因表达情况及其多态性,并采用生物信息学技术对RegX3蛋白的结构和功能进行预测分析。结果临床分离MTB菌株RegX3基因表达率为65.9%(27/41)。测序结果表明,11.1%(3/27)的RegX3基因发生碱基插入、缺失和替换;生物信息学分析表明RegX3蛋白属于稳定蛋白,亲水性强于疏水性。 RegX3蛋白二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,有8个磷酸化位点。结论临床分离菌株RegX3基因阳性率为65.9%,具有高度保守性;RegX3蛋白的生物信息学预测分析为后续研究其蛋白功能奠定了基础。
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文献信息
篇名
结核分枝杆菌RegX3基因表达情况及其蛋白的生物信息学分析
来源期刊
吉林医药学院学报
学科
关键词
结合分枝杆菌RegX3基因
基因多态性
生物信息学
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
7-11
页数
5页
分类号
Q785
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
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被引次数
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G指数
1
陈璐
南京市浦口区中心医院检验科
7
18
2.0
4.0
2
李冰洁
江苏大学医学院检验系
2
0
0.0
0.0
传播情况
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版权信息
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结合分枝杆菌RegX3基因
基因多态性
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
吉林医药学院学报
主办单位:
吉林医药学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1673-2995
CN:
22-1368/R
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1979-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
3647
总下载数(次)
0
总被引数(次)
9870
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