应用离散增量方法识别人类 MicroRNAs 前体序列

• 作者: 张利绒 罗辽复 高智红
• 来源期刊: 内蒙古大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: pre-miRNAs 离散增量 二级结构特征
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 673-677
• 分类号: Q61
• 字数: 3609字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1638.2010.06.014

摘要

MicroRNAs(miRNAs)是一类约为21-26个碱基长度的非编码单链RNA.根据MicroRNAs前体序列(pre-miRNAs)的碱基保守特征和二级结构特征,应用多样性增量方法(ID方法)和支持向量机(SVM)分析,以内含子区(intron)、外显子区(exon)、基因间区(intergenic)三类序列分别作为负集,对人类的pre-miRNAs进行分析和预测.当以intergenic区和intron区序列为训练负集时,其以二级结构三联体、四联体和五联体(3-mer、4-mer、5-mer)为特征参量的敏感性、特异性、整体精度都在89%以上,相关系数在0.7以上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗辽复	内蒙古大学物理科学与技术学院	101	476	12.0	17.0
2	张利绒	内蒙古大学物理科学与技术学院	28	69	6.0	7.0
3	高智红	内蒙古大学物理科学与技术学院	1	1	1.0	1.0