应用16S rDNA克隆文库筛查腹泻病暴发病原体及特异毒力基因验证

• 作者: 刘劼 叶长芸 黄新蓉
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 16S rDNA 腹泻 暴发 粪便 志贺菌
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 900-903
• 分类号: R373
• 字数: 3288字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2010.10.003

摘要

目的 以16S rDNA克隆文库筛查某地腹泻病暴发的病原体,并验证筛查结果 的可靠性.方法 收集12份暴发期内腹泻患者的粪便标本,抽提粪便中总细菌基因组,随机抽取3例患者,应用中国传染病预防控制国家重点实验室建立的16S rDNA克隆文库方法 筛查可能的致腹泻病原菌,根据筛查结果 ,设计致腹泻病原菌特异性毒力基因的引物进行PCR验证,同时对其它9份粪便标本进行该致病菌的PCR检测,根据致病菌的检出比例,确定可能导致本次腹泻病暴发的病原体.结果 用16S rDNA克隆文库在3例患者标本中筛查到2例可能存在志贺菌或大肠杆菌,用针对志贺菌的特异性毒力基因ipaH对该2例患者标本进行PCR检测为阳性.在其它9例腹泻患者粪便标本中6例检测到志贺菌,志贺菌在腹泻病例中的总检出率为66.7%(8/12).16S rDNA克隆文库筛查结果 与志贺菌ipaH基因的验证结果 均显示,3号病例的志贺细菌基因组在粪便总细菌基因组中所占的比例比2号病例高,两种检测结果 具有一致性.结论 志贺菌可能是导致某地本次腹泻病暴发的主要病原体.16S rDNA基因克隆文库法能快速筛查到可能的病原菌,其筛查结果 比较可靠,因此,该方法 对于不明原因疾病暴发流行的病原体筛查具有指导作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘劼	南华大学病原生物学研究所	17	74	6.0	8.0
3	叶长芸	传染病预防控制国家重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	6	64	5.0	6.0
4	黄新蓉	南华大学病原生物学研究所	4	9	2.0	3.0