荧光定量分型PCR、多重PCR和测序检测HBV基因型的方法学比较

• 作者: 张文露 张秀瑜 胡源 袁作为 赵耀 黄爱龙
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乙型肝炎病毒 基因型 实时荧光定量PCR 测序 多重PCR
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 1154-1158
• 分类号: R4
• 字数: 3422字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2010.12.020

摘要

目的 比较荧光定量分型PCR、直接测序和多重PCR三种HBV基因分型法,对本实验室建立的荧光定量分型PCR方法进行评价.方法 用多重PCR、直接测序和荧光定量分型PCR法检测113份HBV DNA阳性的临床样本.结果 荧光定量分型PCR和直接测序法检出率100%,多重PCR法检出率94.69%,6份样本未能分型.荧光定量分型PCR和多重PCR的Kappa系数0.915,荧光定量分型PCR和直接测序法的Kappa系数0.742,一致性均较好.对B/C基因型混合感染样本,荧光定量分型PCR法检出28例(24.78%),多重PCR法检出19例(16.81%),直接测序法检出13例(11.50%).结论 荧光定量分型PCR分型结果准确可靠,对基因型混合感染样本的检出率明显高于多重PCR及直接测序法,是一种高效、简便、快速、准确的HBV基因分型法,适用于大规模流行病学调查.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄爱龙	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	236	1190	16.0	23.0
2	张文露	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	14	34	3.0	5.0
3	赵耀	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	24	74	5.0	7.0
4	胡源	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	14	14	2.0	3.0
5	袁作为	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	5	15	3.0	3.0
6	张秀瑜	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	13	79	6.0	8.0