韭葱黄条病毒黑龙江分离物外壳蛋白基因克隆与序列分析

• 作者: 孟宪欣 张匀华 张威 申宇 白艳菊 耿宏伟 范国权 高艳玲
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 韭葱黄条病毒 外壳蛋白 核苷酸 序列分析 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 60-65
• 分类号: Q785
• 字数: 3429字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2010.08.013

摘要

韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)是大蒜上的重要病毒病害,几乎分布于全国所有大蒜种植区域,严重影响大蒜的产量和品质.对其建立RT-PCR分子检测体系以及对其外壳蛋白(CP)基因进行序列分析尤为重要.根据已报道的LYSV CP基因的核苷酸序列设计合成1对引物,以带毒植株总RNA为模板,应用RT-PCR方法,克隆了LYSV黑龙江分离物(LYSV-HLJ)CP基因全长cDNA序列.结果表明,LYSV-HLJCP基因全长885 bp,编码295个氨基酸残基;与GenBank中其他不同分离物的CP核苷酸序列同源性为79.7%～88.6%,氨基酸序列同源性为83.7%～93.1%.依据LYSV CP氨基酸序列建立系统进化树,将LYSV不同分离物划分为4个类群,LYSV-HLJ与韩国和巴西大蒜上的LYSV有较近的亲缘关系,同属于iv类,表现出一定的寄主相关性.