北柴胡皂苷生物合成途径关键酶IPPI的全长cDNA克隆及其序列分析

• 作者: 战晴晴 杨成民 郑亭亭 陈怀琼 隋春 魏建和
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 北柴胡 柴胡皂苷 异戊烯基焦磷酸异构酶(IPPI) cDNA文库 PCR矩阵法
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1178-1184
• 分类号: R284.2
• 语种: 中文

摘要

目的 克隆北柴胡皂苷生物合成途径关键酶异戊烯基焦磷酸异构酶(EC 5.3.12,isopentenyl diphosphateisomerase,IPPD的全长cDNA,为研究柴胡皂昔的生物合成与基因调控奠定基础.方法 PCR矩阵法快速筛选北柴胡全长cDNA文库.结果 获得了北柴胡IPPI的全长eDNA(GenBank No.gy433719),其核苷酸序列长1 117by,编码319个氨基酸的蛋白.NCBI Blastx结果显示与胡萝卜Daucus carota subsp.sativus (abb52064)的IPPI氨基酸序列相似性最高,一致性为9200,相似度为97%.保守结构域搜索显示含有IPPI共有的催化活性位点、金属结合位点及Nudix基序.TargetPl.1和SignaIP3.0分析表明北柴胡IPPI N端含有长26 by的叶绿体信号肽.结论 首次克隆了北柴胡IPPI的全长cDNA,将促进后续北柴胡IPPI基因表达特性及其在柴胡皂苷合成代谢中功能的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏建和	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	71	1245	21.0	32.0
2	杨成民	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	41	347	11.0	17.0
3	隋春	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	14	228	7.0	14.0
4	陈怀琼	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	5	122	5.0	5.0
5	郑亭亭	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	2	25	2.0	2.0
6	战晴晴	东北林业大学生命科学学院	3	51	3.0	3.0