150例慢性丙型肝炎患者HCV基因型和NS3蛋白酶编码区序列的分析

• 作者: 刘妍 叶海燕 徐东平 李乐 李晓东 李筱涵 毛远丽 王琳
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝炎病毒 DNA指纹法 寡核苷酸序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 1201-1204
• 分类号: R512.62
• 语种: 中文

摘要

目的 对来源于我国不同地区的150例慢性丙型肝炎患者进行HCV基因分型和NS3蛋白激酶编码区序列分析.方法 基因分型采用基因芯片法;NS3区序列扩增采用自行设计的型特异性引物介导巢式RT-FCR,序列分析采用PCR产物直接测序.结果 150例患者HCV基因分型结果为1b占66.7%(100/150),2a占22.7%(34/150),3a占4%(6/150),3b占4%(6/150),6型占2%(3/150),1a占0.7%(1/150).对NS3区序列采用进化树分析进行分型,其结果与基因芯片法分型结果高度一致,主要基因型(1a、2b)的NS3区序列无明显地区性聚集倾向.未检出与新型HCV蛋白酶抑制剂telaprevir耐药相关的V36M/A、T54A、R155K/T和A/156V/T变异.结论 我国慢性丙型肝炎患者仍以1b型感染为主,采用NS3蛋白酶编码区序列分析可同时进行基因分型和针对蛋白酶抑制剂的耐药变异检测,我国天然存在的相对优势变异株发生telaprevir原发耐药的可能性很小.