栽培大豆染色体改构复合体基因SNP5的克隆及序列分析

• 作者: 刘晓东 尹光 张春宝 董英山 赵洪锟
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 栽培大豆 染色质改构复合体 SNP5基因 克隆
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 91-95,100
• 分类号: S5
• 字数: 4232字
• 语种: 中文

摘要

根据大豆耐盐基因表达芯片上提供的表达量下调的EST序列信息,借助了电子克隆方法,根据获得的假定序列设计引物,通过RT-PCR,从栽培大豆克隆了染色体改构复合体SNP5类同源基因.其片段长度为812 bp,编码240个氨基酸的多肽,分子重量为27.4 kD,等电点pI为5.37.NCBI保守结构域分析表明,其属于SNF5超家族,因此我们将其命名为GmSNP5 (GenBank登录号:HM068595).Southern杂交表明,GmSNF5基因在栽培大豆基因中至少有一个拷贝.氨基酸序列及系统进化树分析表明,GmSNF5与其同科的豌豆PsSNF5有较高的同源性,氨基酸序列一致性高达92%.由于其部分EST序列在大豆耐盐芯片中表达量下调,因此推测此基因在功能上与栽培大豆的耐盐性相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵洪锟	吉林省农业科学院生物技术研究中心	34	230	7.0	14.0
2	董英山	吉林省农业科学院生物技术研究中心	58	417	11.0	18.0
3	张春宝	吉林省农业科学院大豆研究中心	22	116	6.0	10.0
4	尹光	吉林省农业科学院生物技术研究中心	1	0	0.0	0.0
5	刘晓东	吉林省农业科学院生物技术研究中心	3	8	1.0	2.0