新城疫病毒F基因重要功能区和HN基因单核苷酸多态性研究

• 作者: 刘培欣 刘怀然 刘胜旺 孔宪刚 张晓东
• 来源期刊: 中国家禽
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 HN基因 单核苷酸多态性 选择压力
• 年，卷（期）: 2010,（16）
• 页码范围: 14-17
• 分类号: S8
• 字数: 3120字
• 语种: 中文

摘要

对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47～435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析.结果表明:在F基因47～435nt间和HN基因中都存在高密度的SNP位点,Tajima's D检验结果表明这些核苷酸变化符合中性突变假说,Pi(a)/Pi(s)分析暗示F蛋白编码基因N端的一些区段和HN蛋白编码基因中散在的部分区域受到了正向选择.但F基因和HN基因在整体上却都受到了强大的负向选择压力的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘培欣	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽传染病研究室	21	302	7.0	17.0
2	张晓东	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽传染病研究室	68	1324	14.0	35.0
3	刘胜旺	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽传染病研究室	53	724	15.0	25.0
4	刘怀然	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽传染病研究室	23	161	8.0	11.0