TLR4基因SNP检测及在中外鸡种中的群体变异分析

• 作者: 刘冉冉 宋咏梅 庞建建 文杰 李鹏 赵兴旺 赵桂苹 郑麦青
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 TLR4 SNP 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2010,（16）
• 页码范围: 1-7
• 分类号: S831.2
• 字数: 3708字
• 语种: 中文

摘要

以9个地方鸡种(北京油鸡、白耳鸡、溧阳鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡、大骨鸡、狼山鸡、仙居鸡、茶花鸡)和3个引进品种(隐性白羽肉鸡、科宝鸡、来航蛋鸡)为素材,利用DNA直接测序技术对Toll样受体4(TLR4)蛋白基因(登陆号为AY064697)的全部外显子、部分内含子及5'调控区共4 373 bp的序列进行单核苷酸多态性检测,共检测到36个SNPs,其中19个SNPs位于编码区(cSNPs),12个集中于第三外显子的特定区域上(蛋白的TRR结构域);10个为错义突变,21个为新发现的SNPs.对集中于第三外显子上的12个SNP位点,在12个品种的688个个体进行了PCR-SBT检测,这些SNPs产生的不同基因型及等位基因在12个鸡品种间分布存在显著的差异,推测与该基因的功能存在相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李鹏	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	100	1145	18.0	30.0
2	赵桂苹	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	51	674	14.0	25.0
3	郑麦青	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	52	860	16.0	28.0
4	刘冉冉	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	21	59	5.0	6.0
5	宋咏梅	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	4	28	3.0	4.0
6	庞建建	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	3	24	2.0	3.0
7	赵兴旺	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	3	15	2.0	3.0