一种新的生物序列模式挖掘算法

• 作者: 常磊玲 朱春鹤
• 来源期刊: 电脑知识与技术：学术交流
• 学科: 工学
• 关键词: 相邻频繁模式段 模式组合 生物序列 模式挖掘 数据挖掘 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 5140-5142
• 页数: 3页
• 分类号: TP311

摘要

针对传统模式挖掘方法挖掘生物序列会生成大量不必要的短而且无用的模式,导致效率降低,在多支持度思想的基础上提出了基于邻近频繁模式段的模式挖掘算法JBioPM。首先,产生邻近短频繁模式段,然后组合这些短频繁模式段,产生新的长频繁模式。通过实验分析,该方法在相似性很强的序列数据库中比BioPM算法效率高。通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱春鹤	上海海事大学信息工程学院	6	15	2.0	3.0
2	常磊玲	上海海事大学信息工程学院	2	2	1.0	1.0