基于串联质谱的快速肽段鉴定算法

• 作者: 徐云 李文军 王颖 邵明芝
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 工学
• 关键词: 串联质谱 肽段鉴定 碎片离子 有效峰提取
• 年，卷（期）: 2010,（18）
• 页码范围: 214-216
• 分类号: TP391
• 字数: 2791字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3428.2010.18.074

摘要

在现有RT-PSM算法的基础上,完成蛋白质数据库酶切成肽段数据库的转换过程,提出有效峰提取的优化策略,设计一个肤段鉴定算法--FPI-PSM.对于没有翻译后修饰的情形,采用Keller数据集进行测试.与RT-PSM算法相比,FPI-PSM算法的灵敏度提高了5%,每个质谱的平均鉴定时间从13.6 ms下降到5.6 ms.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王颖	中国科学技术大学计算机科学技术系	147	1291	18.0	30.0
3	徐云	中国科学技术大学计算机科学技术系	79	411	13.0	16.0
5	李文军	中国科学技术大学计算机科学技术系	48	348	10.0	17.0
9	邵明芝	中国科学技术大学计算机科学技术系	2	1	1.0	1.0