子痫前期易感基因HLA-G SNPs的生物信息学分析和筛选

• 作者: 崔洪艳 张春红 李延杰 贾艳菊 陈叙
• 来源期刊: 中国妇幼保健
• 学科: 医学
• 关键词: 子痫前期 HLA-G 单核苷酸多态性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（33）
• 页码范围: 4895-4898
• 分类号: R714.24+5
• 语种: 中文

摘要

目的:应用生物信息学的方法分析疾病相关基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,筛选可导致子痫前期易感基因HLA-G功能变化的SNPs位点.方法:使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA-G编码区的SNPs数据,并下载SNPs位点侧翼序列,使用PARSESNP软件进行分析.结果:在HLA-G基因的编码区发现5个SNPs位点(C343T、C348T、A396T、A466G、C1903T),PSSM Difference分别为19.5、17.4、15.6、6.8和16,其单核苷酸的变化会引发错义突变,且PSSM Difference>10的突变很可能为有害突变.结论:本文应角生物信息学策略对子痫前期易感基因HLA-G编码区的SNPs进行分析,搜寻对HLA-G基因表达和蛋白质结构及功能产生影响的SNPs,为疾病与基因的关联性研究提供很有价值的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈叙	天津市中心妇产科医院产科	47	335	8.0	17.0
2	张春红	天津市中心妇产科医院产科	6	30	2.0	5.0
3	李延杰	天津市中心妇产科医院产科	6	7	1.0	2.0
4	崔洪艳	天津市中心妇产科医院产科	18	62	4.0	7.0
5	贾艳菊	天津市中心妇产科医院产科	12	30	2.0	5.0