德国小蠊变应原BgGSTD1的抗原表位特征及三维结构建模

• 作者: 何韶衡 张伟 杨海伟 胡玉静 金珊珊 魏继福
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 德国小蠊 谷胱甘肽转移酶 抗原表位 三维结构建模
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 18-22
• 分类号: Q819
• 字数: 2788字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7783.2011.01.005

摘要

目的:通过生物信息学方法了解德国小蠊变应原BgGSTD1的结构特征,为蟑螂变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索.方法:在NCBI数据库中获得BgGSTD1蛋白序列,Blast得到其相似序列,并应用Clustalx 1.83构建同源进化树,联合应用DNA Star多种方法预测其抗原表位,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,并应用SWISS- MODEL服务器进行自动建模,得到其三维结构.结果:德国小蠊BgGSTD1与美洲大蠊谷胱甘肽转移酶在进化上具有较近的亲缘关系.BgGSTD1主要为α+β结构的混合蛋白,其主要抗原表位集中于9-10,58-61,79-81,86-87,179-180,189-190,216.Motif预测其具有一个谷胱甘肽转移酶N-末端区和谷胱甘肽转移酶C-末端区.Swiss-Model服务器预测的三维结构基本能反应BgGSTD1真实的空间构象.结论:通过BgGSTD1的生物信息学分析获得了该变应原分子特征及三维结构模型,为进一步了解和掌握BgGSTD1的结构功能打下理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨海伟	南京医科大学第一附属医院临床实验研究中心	15	75	5.0	7.0
2	魏继福	南京医科大学第一附属医院临床实验研究中心	25	131	7.0	10.0
3	何韶衡	南京医科大学第一附属医院临床实验研究中心	45	208	8.0	11.0
4	张伟	南京医科大学第一附属医院临床实验研究中心	66	285	9.0	14.0
5	胡玉静	南京医科大学第一附属医院临床实验研究中心	4	19	3.0	4.0
6	金珊珊	南京医科大学第一附属医院临床实验研究中心	10	31	4.0	5.0