从烟草上分离的中国番茄曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征

• 作者: 卢燕回 廖咏梅 李战彪 李波 蒙姣荣 陈保善 韦茂春
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 农学
• 关键词: 中国番茄曲叶病毒 烟草 双生病毒 DNA-A 卫星DNA
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 281-287
• 分类号: S511
• 字数: 4950字
• 语种: 中文

摘要

本研究从具有典型曲叶病症状的广西靖西烟草病植株上分离到病毒分离物JX-2，全基因组序列测定结果表明，JX-2DNA．A全长2738个核苷酸，共编码6个开放阅读框架（openreadingframes，ORFs），其中病毒链编码AV1（CP）和AV2两个ORFs，互补链编码AC1、AC2、AC3和AC4共4个ORFs。BLAST结果表明，JX-2DNA—A与中国番茄曲叶病毒（Tomato leaf curl Chinavirus，ToLCCNV）各分离物的相似性在93．0％-99．7％之间，其中与ToLCCNV广西番茄分离物ToLCCNV．G32的相似性最高，达99．7％，而与其它双生病毒的同源性均在88．0％以下，表明Jx-2是ToLCCNV的一个分离物。基于Jx-2和已报道的双生病毒属代表种DNA-A全基因组核苷酸序列构建的系统进化树显示，JX-2与ToLCCNV-G32分离物的亲缘关系最近，并与ToLCCNV其它分离物形成一个分支，而与其它10种双生病毒的亲缘关系均相对较远。利用双生病毒卫星DNAβ的特异性引物β01／β02在Jx-2样品中扩增到DNAβ分子（JX-2β），全长为1341个核苷酸，其互补链编码1个ORF（即βC1），并包含一个富含A序列和一个卫星病毒保守序列。序列分析表明，JX-2β与ToLCCNV伴随的DNAβ的相似性在91．0％～96．1％之间，其中与ToLCCNV-G61DNAβ和ToLCCNV—G18DNAβ的相似性最高（96．1％），与其它卫星DNAβ的相似性均低于61．8％。基于JX-2β全基因组核苷酸序列构建的系统进化关系树显示，JX-29与ToLCCNVG61分离物伴随的DNAβ亲缘关系最近，并形成一个独立的分支，再与ToLCCNV其余两个分离物伴随的DNAβ形成一个较大的分支。这是首次报道从烟草中分离到的中国番茄曲叶病毒及其伴随卫星DNA分子的全基因组结构特征。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢燕回		10	24	3.0	4.0
2	李波		2	3	1.0	1.0
3	李战彪		1	3	1.0	1.0
4	韦茂春		1	3	1.0	1.0
5	廖咏梅		1	3	1.0	1.0
6	陈保善		1	3	1.0	1.0
7	蒙姣荣		1	3	1.0	1.0