7种植物K~＋/H~＋逆向转运蛋白的生物信息学分析

• 作者: 宋志忠 王莉 苏彦华 韩蕾
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物K+/H+逆向转运蛋白 进化保守性 结构特征 基因表达
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 数据分析
• 页码范围: 372-378
• 分类号: Q948.524.5
• 语种: 中文

摘要

K＋/H＋逆向转运是普遍存在于几乎所有生物体内的重要离子平衡机制之一。该机制主要由多基因家族KEA（K efflux antiporter）介导。然而,长期以来对KEA的功能特征和生理意义的认识,除了在大肠杆菌中有零星的报道之外,绝大部分尚为空白。本文通过生物信息学分析,比较了7个植物物种KEA的同源和进化关系,发现KEA家族中的部分成员在物种进化过程中具有极高的保守性。以模式植物拟南芥为例,进一步研究了KEA的蛋白质跨膜结构、关键结构域和亚细胞定位预测等。结果表明,AtKEA大多具有10～12个跨膜结构,是典型的膜蛋白,在跨膜区的N端有多个丝氨酸磷酸化调控位点;都含有K＋/H＋交换结构域和相应的调控域,推测其能够介导K＋/H＋交换。基因芯片研究表明,AtKEA在根、茎、叶、花和荚果等不同组织器官的表达丰度不同,表明KEA基因家族各成员的生理功能具有时空分异性。上述结果可为进一步深入研究植物K＋/H＋逆向转运系统的功能提供借鉴。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏彦华	土壤与农业可持续发展国家重点实验室中国科学院南京土壤研究所	8	66	4.0	8.0