仿刺参超氧化物歧化酶基因cDNA全序列的克隆及其特征分析

• 作者: 常亚青 田燚 马增艳
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 仿刺参 MnSOD 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 97-107
• 分类号: S968.9
• 字数: 7180字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2011.05.014

摘要

以仿刺参Apostichopus japonicus为材料,利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法首次得到仿刺参MnSOD的全长cDNA.该全长cDNA大小为955bp,其中5′端非编码区67 bp,3′端非编码区216 bp,开放阅读框(ORF)672bp,在3 ′端有多聚腺苷酸信号序列ATTTA,并有polyA加尾,符合有效翻译的基因全长cDNA的特征.MnSOD全长cDNA可编码223个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子质量为24.64kD,理论等电点是6.66,为亲水性蛋白.该蛋白序列没有信号肽和跨膜结构,仅有一段线粒体导肽.其二级结构主要以α-螺旋为主,无规则卷曲和延伸链构成了蛋白中量最大的结构元件,不含β-折叠.仿刺参SOD的氨基酸序列与目前已报道的其他物种如人、牛、斑马鱼、原鸡、非洲爪蟾、中国对虾、皱纹盘鲍、海湾扇贝、果蝇等的MnSOD氨基酸序列进行序列比对的结果表明,相似性均在61％～69％o之间,说明该基因在各物种间具有一定的保守性.该段氨基酸序列无N-糖基化位点,含有3个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个肉豆蔻酰基化位点,还发现了1个SOD家族的特征肽段DVWEHAYY.对磷酸化位点分析发现,有1个丝氨酸Ser,3个苏氨酸Tyr可能成为蛋白激酶磷酸化位点.二硫键分析表明,SOD含有3个半胱氨酸Cys,形成1个二硫键,连接着第17位和第107位的Cys.仿刺参MnSOD全长cDNA的克隆为更好地理解生物体内防御系统的催化O2-发生歧化反应、消除活性氧、维持机体活性氧代谢的平衡提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常亚青	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	142	766	15.0	19.0
2	田燚	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	17	69	5.0	7.0
3	马增艳	大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	3	10	2.0	3.0