3种大蒜中洋葱黄矮病毒的RT-PCR分子鉴定

• 作者: 李唯 李金娟 栗孟飞 许蕊 马雯
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 洋葱黄矮病毒(OYDV) 反转录-聚合酶链式反应 病毒检测 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 330-335
• 分类号: Q78
• 字数: 4190字
• 语种: 中文

摘要

洋葱黄矮病毒（Onion yellow dwarf virus,OYDV）是危害大蒜产量和品质的主要病毒之一。快速有效的病毒检测方法可为大蒜病毒病的研究和有效防御提供理论与技术资料。本研究利用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）技术对甘肃＂成县迟蒜＂和山东＂鲁蒜王2号＂中OYDV外壳蛋白基因进行特异性扩增,并克隆到载体PMD18-TEasy Vector上进行核苷酸序列测定及分析。成功分离得到OYDV的两个DNA片段——GSCCS和SDLSW2,与GenBank中已报道的AB000837.1、AB000838.1和AJ409311.1等22个OYDV DNA片段的核苷酸相似性分别为81%～98%和81%～84%,氨基酸相似性分别为85%～99%和89%～94%,二者之间核苷酸相似性为84%,氨基酸相似性为89%。系统进化树显示不同DNA片段可聚为3个组群,GSCCS与中国山东金乡OYDV DNA片段同属一组,SDLSW2与其它16个OYDV DNA片段同属一组,表明OYDV在甘肃＂成县迟蒜＂和山东＂鲁蒜王2号＂中均存在,但具有一定差异。本实验确定了OYDV的基因变异程度,为进一步研究病毒进化和变异提供了有利条件。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李唯	甘肃农业大学生命科学技术学院	81	1278	17.0	32.0
2	栗孟飞	甘肃农业大学生命科学技术学院	28	201	9.0	14.0
3	马雯	甘肃农业大学生命科学技术学院	5	8	1.0	2.0
4	李金娟	甘肃农业大学生命科学技术学院	5	47	2.0	5.0
5	许蕊	甘肃农业大学生命科学技术学院	2	2	1.0	1.0