草菇gpi基因结构及其异核体表达协同增效作用

• 作者: 刘新锐 刘朋虎 朱坚 江玉姬 谢宝贵 贵甫 邓优锦 陈炳智
• 来源期刊: 食用菌学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄糖-6-磷酸异构酶 基因结构 可变剪切 协同增效作用
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 1-5
• 分类号: S646.13
• 字数: 3664字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9873.2011.04.001

摘要

以草菇(Volvariella volvacea)单孢菌株PYd21(基因组测序菌株)和PYd15(基因组重测序菌株)为材料,配对获得可正常出菇的异核菌株H15-21.克隆测序了PYd21和PYd15的葡萄糖-6-磷酸异构酶基因(gpi),并对基因的结构和表达谱的表达量进行分析.结果表明,PYd21和PYd15的gpi基因序列相同；转录组reads定位、paired-end分析结果显示,gpi基因全长2404 bp,ORF全长1659 bp,编码552个氨基酸,含有8个外显子、7个内含子,5'UTR长度为101 bp、3'UTR为183 bp,RNA加工过程中有2种可变剪切类型、3个可变剪接位点；表达谱测序结果,PYd21、H15-21和PYdI5 gpi基因的表达量分别为84.53、1079.31和270.95TPM,草菇gpi基因表达表现出异核体表达协同增效作用,暗示着异核菌株中的2种不同来源的细胞核可能存在相互作用,这一结果在实时荧光定量PCR检测后得到证实.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘新锐	福建农林大学菌物研究中心	44	287	10.0	14.0
2	谢宝贵	福建农林大学菌物研究中心	186	1536	20.0	28.0
3	朱坚	福建农林大学菌物研究中心	44	244	9.0	14.0
4	江玉姬	福建农林大学菌物研究中心	68	515	13.0	20.0
5	刘朋虎	福建农林大学菌物研究中心	56	275	9.0	14.0
6	陈炳智	福建农林大学菌物研究中心	21	60	4.0	7.0
7	邓优锦	福建农林大学菌物研究中心	44	315	12.0	16.0
8	贵甫	福建农林大学菌物研究中心	2	14	1.0	2.0