不同提取缓冲液对红树林土壤DNA提取品质的影响

• 作者: 蒋云霞 郑天凌
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 红树林土壤 DNA提取 DNA产量 腐殖酸 提取缓冲液
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 红树林
• 页码范围: 87-93
• 分类号: P714.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2011.02.013

摘要

针对1种典型的酸性、高有机质含量类型土壤-红树林土壤,从DNA产量、DNA纯度、土壤腐殖酸类物质的提取量以及DNA提取物PCR(polymerase chain reaction)扩增反应的敏感度等方面比较了不同提取缓冲液对土壤DNA品质的影响.结果表明,酸性SDS(sodium dodecyl sulfate)提取缓冲液所获得的土壤DNA产量及纯度均较低;PVP (polyvinylpyrrolidone)提取缓冲液所获得的土壤DNA产量较高,但土壤腐殖酸类物质的提取量亦远高于其他提取缓冲液;酸性SDS提取缓冲液及PVP提取缓冲液所获得的土壤DNA提取物即使稀释到10-3量级亦不能获得目的基因PCR扩增条带.PVPP(polyvinylpolypyrrolidone)提取缓冲液及CTAB(cetyltrimethylammoniumbromide)+PVPP提取缓冲液所获得的土壤DNA产量较PVP提取缓冲液低,但其纯度较高,并且其纯度随提取缓冲液中PVPP浓度的升高而提高;当2%PVPP提取缓冲液及CTAB+PVPP提取缓冲液所获得的土壤DNA提取物分别稀释到10-2及10-1量级时,均能获得PCR扩增条带.综上所述,酸性提取缓冲液及PVP提取缓冲液不适用于酸性、高有机质含量类型土壤DNA的提取,而2%PVPP提取缓冲液及CTAB+PVPP提取缓冲液均能提高此类土壤DNA的提取品质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑天凌	厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室	100	2722	30.0	49.0
5	蒋云霞	南方医科大学公共卫生与热带医学学院环境卫生学系	7	39	4.0	6.0