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摘要:
通过cDNA末端快速扩增技术(RACE),从海湾扇贝(Argopecten irradians)中克隆得到了组织蛋白酶L基因(AiCL)的编码区全长,为1095 bp,推测编码364个氨基酸.经比对与分析发现蛋白序列中存在4个组织蛋白酶L活性位点保守氨基酸:Q164,C170,H309,N329;6个极为保守的半胱氨酸残基:C167,C201,C210,C243,C302,C351.预测其N端17个氨基酸为信号肽序列,C端ASYPTV可能也是分泌信号.AiCL成熟蛋白分子由219个氨基酸构成,前体肽的切割位点预计在A145和M146之间.序列同源性分析中,AiCL蛋白序列与软体动物同源蛋白最为相似,序列一致性在50%以上,在系统进化树中与其它无脊椎动物组织蛋白酶L聚合到一起.通过SwISS-MODEL构建的AiCL成熟蛋白三维模型表明该蛋白空间结构高度保守.根据其序列特征,推测~CL可能具有水解多种肌蛋白的活性.
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文献信息
篇名 海湾扇贝组织蛋白酶L基因编码区的克隆和分析
来源期刊 海洋通报 学科 农学
关键词 海湾扇贝 组织蛋白酶L基因 克隆 序列分析
年,卷(期) 2011,(3) 所属期刊栏目 论文
研究方向 页码范围 338-343
页数 分类号 S917
字数 3612字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-6392.2011.03.017
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李莉 中国科学院海洋研究所 137 1599 22.0 35.0
2 李娟 中国科学院海洋研究所 209 2733 24.0 47.0
6 张国范 中国科学院海洋研究所 123 2348 26.0 43.0
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研究主题发展历程
节点文献
海湾扇贝
组织蛋白酶L基因
克隆
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
海洋通报
双月刊
1001-6392
12-1076/P
16开
天津市河东区六纬路93号
1972
chi
出版文献量(篇)
2159
总下载数(次)
9
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