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海湾扇贝组织蛋白酶L基因编码区的克隆和分析
海湾扇贝组织蛋白酶L基因编码区的克隆和分析
作者:
张国范
李娟
李莉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
海湾扇贝
组织蛋白酶L基因
克隆
序列分析
摘要:
通过cDNA末端快速扩增技术(RACE),从海湾扇贝(Argopecten irradians)中克隆得到了组织蛋白酶L基因(AiCL)的编码区全长,为1095 bp,推测编码364个氨基酸.经比对与分析发现蛋白序列中存在4个组织蛋白酶L活性位点保守氨基酸:Q164,C170,H309,N329;6个极为保守的半胱氨酸残基:C167,C201,C210,C243,C302,C351.预测其N端17个氨基酸为信号肽序列,C端ASYPTV可能也是分泌信号.AiCL成熟蛋白分子由219个氨基酸构成,前体肽的切割位点预计在A145和M146之间.序列同源性分析中,AiCL蛋白序列与软体动物同源蛋白最为相似,序列一致性在50%以上,在系统进化树中与其它无脊椎动物组织蛋白酶L聚合到一起.通过SwISS-MODEL构建的AiCL成熟蛋白三维模型表明该蛋白空间结构高度保守.根据其序列特征,推测~CL可能具有水解多种肌蛋白的活性.
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文献信息
篇名
海湾扇贝组织蛋白酶L基因编码区的克隆和分析
来源期刊
海洋通报
学科
农学
关键词
海湾扇贝
组织蛋白酶L基因
克隆
序列分析
年,卷(期)
2011,(3)
所属期刊栏目
论文
研究方向
页码范围
338-343
页数
分类号
S917
字数
3612字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-6392.2011.03.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李莉
中国科学院海洋研究所
137
1599
22.0
35.0
2
李娟
中国科学院海洋研究所
209
2733
24.0
47.0
6
张国范
中国科学院海洋研究所
123
2348
26.0
43.0
传播情况
被引次数趋势
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组织蛋白酶L基因
克隆
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
海洋通报
主办单位:
国家海洋信息中心
中国海洋学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-6392
CN:
12-1076/P
开本:
16开
出版地:
天津市河东区六纬路93号
邮发代号:
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
2159
总下载数(次)
9
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