二芳基三嗪类HIV-1逆转录酶抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究

• 作者: 孙家英 李建 林治华 梅虎 王琴 闫宁
• 来源期刊: 化学通报（印刷版）
• 学科: 化学
• 关键词: 三维定量构效关系 比较分子相似性指数分析 分子对接 二芳基三嗪 逆转录酶抑制剂
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 54-60
• 分类号: O6
• 字数: 3202字
• 语种: 中文

摘要

对40个二芳基三嗪类HIV-1逆转录酶抑制剂进行了分子对接研究,结果表明,2个疏水性芳香取代基团与结合口袋底部形成的疏水和范德华相互作用、三嗪环母核及其R4取代基与结合位点产生的氢键和静电作用以及R4取代基与袋口形成的空间位阻效应是影响该系列化合物活性的重要因素.根据对接优势构象进行分子叠合和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)研究,建立了4个高预测能力的3-D构效关系模型,其中以选用立体场、静电场和疏水场建立的CoMSIA模型为最优,其主成分,r2,q2(LOO)和r2pred分别为6,0.971、0.738和0.833.模型结果表明,3个力场对活性贡献由大到小依次为疏水场、静电场和立体场.CoMSIA等势图分析结果与对接分析相一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林治华	重庆理工大学化学与生物工程学院	45	155	5.0	11.0
2	梅虎		38	299	8.0	15.0
6	李建	重庆大学生物工程学院	6	43	5.0	6.0
7	王琴		9	71	4.0	8.0
8	孙家英	重庆大学生物工程学院	6	62	3.0	6.0
9	闫宁	重庆大学生物工程学院	2	15	2.0	2.0