脊尾白虾3个野生群体线粒体COI基因的遗传多样性及其系统发育分析

• 作者: 刘萍 李健 李吉涛 陈萍 马朋
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 脊尾白虾 野生群体 COI基因 遗传多样性 系统进化
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 50-56
• 分类号: S961.6
• 字数: 4864字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2011.06.008

摘要

采用PCR扩增技术对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾的3个野生群体共计62个个体的线粒体COI基因片段进行扩增和测序,获得长度为658 bp核苷酸序列.62条序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为31.53％、22.63％、27.30％、18.53％和58.83％,A+T含量显著高于G+C含量,这一结果与甲壳类、双壳贝类等的COI线粒体基因片段中的观察结果相似.通过统计变异位点、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数进行基因序列变异分析.AMOVA分析表明,3群体间总遗传分化系数Fst=0.3611(P＜0.01),群体间存在较高的遗传分化,其中象山湾群体与莱州湾群体之间的遗传分化系数最高,莱州湾群体与海洲湾群体之间的遗传分化系数最低.另外用MEGA4.0软件中的NJ法构建分子进化树,同时由NCBI下载同源序列,探讨了长臂虾亚科几个种的系统进化关系,用NJ法构建的系统树显示,脊尾白虾不同单倍型先与长臂虾属和小长臂虾属聚为一支,然后与沼虾属聚为一支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马朋		3	31	3.0	3.0