嗜水气单胞菌诱导的池蝶蚌血细胞cDNA文库的构建和亲环蛋白基因序列的初步分析

• 作者: 徐灵 曾柳根 洪一江 王军花 盛军庆 谢凯
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 池蝶蚌 血细胞 cDNA文库 嗜水气单胞菌 亲环蛋白
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 页码范围: 783-789
• 分类号: Q785
• 字数: 5347字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00783

摘要

实验利用灭活的嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)诱导处于四龄池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)14h,将诱导后的池蝶蚌血细胞的总RNA进行逆转录,用LD-PCR法合成双链cDNA,从而首次成功构建池蝶蚌血细胞的全长cDNA文库.原始文库的滴度为4× 106cfu/cm3,重组率为90%,扩增后文库的滴度为3.55× 109pfu/mL.目前文库已随机测序672个样品,将所得双向序列进行拼接,去除载体,并多序列比对去除重复序列后,发现436条为已知功能序列,其余为未知功能序列.序列中最小长度270 bp,最大长度为2153 bp,平均大小608.6 bp,表明插入片段大小理想.从文库中筛选获得免疫相关基因池蝶蚌亲环蛋白A(HsCypA)全长基因并进行序列分析.结果显示,HsCypA全长1229 bp,序列包括52 bp的5’非编码区、495 bp的开放阅读框、682 bp的3’非编码区和29 bp的poly(A)尾,没有明显的加尾信号.对Cyp A氨基酸序列二级结构进行了较详细的分析并进行了三维建模,同时构建了其系统进化树,分析表明亲环蛋白家族是一个在进化上非常保守的蛋白家族.综合分析,Cyp A在水生动物中不仅仅只是一种组成型蛋白,而是可能在病原感染防御中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾柳根	南昌大学生命科学与食品工程学院	12	99	6.0	9.0
2	王军花	南昌大学生命科学与食品工程学院	50	354	9.0	16.0
3	洪一江	南昌大学生命科学与食品工程学院	92	677	16.0	20.0
4	盛军庆	南昌大学生命科学与食品工程学院	30	173	7.0	11.0
5	谢凯	南昌大学生命科学与食品工程学院	8	29	4.0	5.0
6	徐灵	南昌大学生命科学与食品工程学院	7	14	2.0	3.0